一般來說，基金申購有二種方式，第一種稱為「單筆投資」，而第二種為「定時定額」。
單筆投資是指一次拿出一筆金額，判斷市場時點買進基金，由於買入基金的價格(即淨值)在申購時即決定，因此單位數也是固定，舉例來說：小明於2010/6/1申購元大全球短期收益基金50000元整，當天淨值為10元，因此小明買到的單位數為50000/10=5000(單位數)，假設小明之後都沒有對元大全球短期收益基金進行申購或是贖回，則到了2010/10/1，小明所擁有之元大全球短期收益基金單位數仍然還是5000，維持不變。而定時定額申購的方式則是以「定時」方式搭配「固定金額」投資基金，以元大投信定時定額機制舉例，每個月有8、18、28這三天可自行選擇扣款，投資人若僅選擇每月8號扣款，每次扣款金額3000元整，這種投資方式就是定時定額。與單筆投資相比，定時定額較不用在乎進場時間點，時間到了銀行就會自動扣款。由於定時定額申購每次申購總金額不變，但單位數會隨著基金淨值變化，基金淨值越高，則買到的單位數越少；基金淨值越低，則同樣金額買到的單位數越多，即以平均成本的概念來達到分散投資風險。

若投資國內投信發行之基金，則視該基金在公開說明書中對收益分配的訂定，若該基金的收益採不分配政策，則目前因免課徵證券交易所得稅，故資本利得部分亦沒有稅負問題；但若該基金收益採分配政策，則該基金配息金額中，屬實現獲利的資本利得部份不須課稅，配息金額中利息收入、現金股利、已實現股票股利等部份，就須納入27萬元利息所得免稅額中申報。

然而若投資的是海外基金所發行的境外基金，隨著2010年最低稅負制執行，境外基金的資本利得與收益分配均需納入課徵範圍，但要注意的是，兩者加起來必須超過門檻新台幣100萬元，才需申報基本所得稅額。然若一申報戶全年之海外所得合計數未達新臺幣100萬元者，則不用計入基本所得額。